技術(shù)文獻
PCR擴增實驗中經(jīng)常出現(xiàn)的問題及解決辦法
在進行PCR擴增時,京城會遇到一些問題,需要改變各種影響PCR擴增的參數(shù)及條件,以改善反應(yīng)產(chǎn)物的常量和特異性。
1、沒有得到所希望的PCR擴增產(chǎn)物。
、俅_定是加入酶,檢查酶是否具有活性。
、贒NA分子解鏈是否充分。
、奂尤氲娜斯ず铣梢锸欠駹幦。
④在未加入Taq DNA聚合酶之,將反映系統(tǒng)放置在95℃保溫5-10分鐘,以使蛋白酶及核酸酶失去活性。
2、PCR擴增產(chǎn)物在凝膠電泳中呈片狀。
、贉p少Taq DNA聚合酶的濃度。
、谠黾油嘶鸬臏囟
、劢档蚆g++的濃度。
④減少擴增循環(huán)周期次數(shù)。
、轀p少退火及延伸的時間。
、迯哪z中回收與所希望的段大小相同的DNA,再次進行PCR擴增。
3、凝膠電泳中出現(xiàn)引物二聚體區(qū)帶
、贆z查引物的3`-端是否互補。
、谠O(shè)計較長的引物。
、墼黾影心繕薉NA的量。
、芙档鸵锏臐舛。
、轀p少擴增循環(huán)周期次。
、拊黾油嘶鸬臏囟
4、PCR擴增產(chǎn)物特異性不夠
、僭黾油嘶鸬臏囟取
、跍p少退火及延伸時間。
、劢档鸵锖蚑aq DNA聚合酶的濃度。
、芨淖僊g++的濃度
預(yù)防PCR擴增中污染的措施:
1、擴增所用的試驗要少量分裝保存,為一次實驗的使用。
2、實驗中實驗人員要穿工作服、戴手套,尤其是RT-PCR擴增的過程中必須戴手套。
3、實驗中加取標本和反應(yīng)試劑要迅速、準確、盡量減少標本取樣的次數(shù),并就近操作,避免遠距離一樣,陽性對照加入。
4、PCR擴增實驗中所使用的要用,不可竄用。
5、實驗中使用的加樣頭,標本處理和擴增用的離心管要高壓滅菌消毒。
6、加權(quán)樣本和擴增產(chǎn)物時,不要反復(fù)抽吸和空吸,避免產(chǎn)生氣溶膠,污染實驗室。
7、要嚴格執(zhí)行先加入反映實際,后加入標本DNA。
8、擴增過程中的流程要有次序,避免已經(jīng)入下步驟的擴增標本,返回到一步驟,造成污染。
PCR擴增過程中污染的主要來源
核算擴增是一項很有效的技術(shù),但同時優(yōu)勢很靈敏的方法以至于很容易出現(xiàn)假陽性的反應(yīng),這種假陽性反應(yīng)的干擾主要產(chǎn)生于3個方面
1、應(yīng)用DNA質(zhì)粒作為核算擴增反應(yīng)的陽性對照。
2、DNA由林勇標本,培養(yǎng)物或由被污染的試劑延續(xù)下來。
3、擴增DNA的污染(即PCR產(chǎn)物)。
PCR擴增產(chǎn)物污染的主要排出方法:
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原創(chuàng)作者:本生(天津)健康科技有限公司
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